23 sep 2013

TPDL 2013 Keynote

De officiële opening van het TPDL 2013 congres wordt verricht door een aantal officials, zoals de Minister van Educatie van Malta, enkele UNESCO officials (Valetta wil, net als Leeuwarden in 2018 Culture Hoofdstad van Europa worden) en een COST.eu (financieringsprogramma voor onderzoek) vertegenwoordiger en iemand van de Universiteit van Malta (toch nog 14 faculteiten).
De COST-vertegenwoordigster memoreerde dat de Johannieter Orde (sinds 1564 Valetta), de eerste Europese samenwerking was.
[Heb een fraaie catalogus gevonden van een tentoonstelling uit 2009 van de archieven van de Johannieters).
*
De openings keynote wordt uitgesproken door Christine Borgman. Van haar had ik al het boek gelezen “Scholarship in the digital age.
Christine Borgman.MIT Press, 2007. Goed gedocumenteerd boek met een beschrijving van de nieuwste ontwikkelingen op het gebied van wetenschappelijk onderzoek. Heel breed en daardoor worden veel onderwerpen slechts aangestipt. Ook over het belang van incentives voor het opslaan van data bijvoorbeeld. Geeft toch een aardig overzicht van de gevolgen van internet voor onderzoek.
Ook in deze keynote blijkt ze goed gedocumenteerd en geeft een heel mooi overzicht over een van de grootste issues in de wetenschap: Research Data Management. Digital scholarship, aldus Borgman "encompasses the tools, its about services and infrastructure that supports research too". Daarbij noemt ze ook nog het het recente OA rapport waaruit blijkt dat al meer dan de helft van de publicaties openbaar toegankelijk zijn.
Binnenkort komt er een nieuw boek van haar uit: “Big data, small data, no data: digital libraries past, present and future“ Daarin beschrijft ze vier duidelijke trends:
1. Open scholarship is norm (open data, open collaborations, open publication, open dissemination, open ontologies, open access attitudes)
2. Formele en informele publicaties lopen door elkaar heen, dus ook credits (altmetrics) [al in 1964 beschreven Garvey & Griffith in Science het verschil – ook in waardering – tussen formele en informele publicaties]
3. Data is lokaal bepaald (big data kan ‘big’ zijn in omvang, varieteit en snelheid (velocity) verschil tussen disciplines ‘índustrial tools vs artisanal tools’, long tail
4. Open data veroorzaakt een paradigma verschuiving (doel van onderzoek is niet langer de publicatie maar het hergebruik van de data)

Data sharing is not a technical issue, but a cultural

Haar presentatie is beschikbaar via haar website.

22 sep 2013

Tutorial TPDL 2013




Het 17e International Congress on Theory and Practice of Digital Libraries begon vanochtend in het Grand Hotel Excelsior in Floriane(Valetta) op Malta met de tutorials.
Ik had me ingeschreven voor de tutorial: “From Preserving Data to Preserving Research: Curation of Process and Context” die georganiseerd werd door deelnemers aan het EU-project Wf4ever (Workflow for ever), waarbij het vooral gaat om de digitale curatie van het onderzoeksproces.
In zijn introductie ging Andreas Rauber in op het Microsoft boek The fourth paradigm, dat - gebaseerd op de concepten van Gray de ontwikkeling van de wetenschap ziet in 4 fasen: empirisch, theoretisch, computationeel en (nu) data-driven.
En wat heeft data-driven science meer nodig dan curatie?!
Een DMP (data mangement plan) is niet genoeg, aldus Rauber en hij haalt een casus aan waarbij door verandering in software eerder uitgevoerd onderzoek niet meer repliceerbaar was.

De uitdaging is om het proces, in zijn context vast te leggen
we need to move beyond the concept of data and capture ‘all’ elements of a research process
Rudof Mayer deed daarna het onderzoek uit de doeken. Hij heeft een model gemaakt van een methode die muziek automatisch kan caegoriseren. Daarbij maakte hij gebruik van externe bronnen voor de data en probeerde de kenmerken te exteaheren en via een machine-leerproces de software te finetunen.

Om dit proces te beschrijven maakte hij gebruik van een bestaand metadata model genaamd ArchiMate.
ArchiMate kan verschillende layers beschrijven in de processen voor informatieontsluiting, gedrag en structuur. Uiteindelijk leidde dat tot ontologieen.

Rudolf Mayer legt het proces van process- capturing uit, ook beschreven in Timbus- Project.
Het basismodel wat daaruit ontstond heeft hij uitgebreid met verdere ontologieen, met gebruikmaking van verschillende tools, zoals the software ontology, mapping metadata met Premis, CUDF voor software dependencies, en handmatig voor sensors.
Ze hebben verschillende tools ontwikkeld om een aantal van die gegevens automatisch te extraheren, maar die moeten wel worden aangevuld met handmatige aanvullingen.
Na Mayer was het de beurt aan Daniel Garijo en Raul Palma om het idee van Research Objects uit te leggen en te demonstreren. Ze lieten zie hoe het door Mayer in ontologieen beschreven proces kan worden omgezet naar Research Objects. Een Research Object is een bundel van alle bronnen die nodig zijn voor een -experimenteel - onderzoeksproces.
The resources aggregated by a Research Object can be: data used or results produced in an experiment study; (computational) methods employed to produce and analyse that data; or people involved in the investigation
* Tijdens de koffie verduidelijkte Daniel dat nog eens door te zeggen dat ook bijvoorbeeld een pdf van een publicatie met al zijn onderdelen een Research Object kan zijn.*
Annotatie is belangrijk voor een Research Object.
Waarom linked data niet genoeg is voor onderzoekers is de titel van een artikel van Bechhofer e.a. in Recent Advances in e-Science, en het antwoord is Research Objects.
Tijdens de demo over het maken van een Research Objects liet Raul Palma zien hoe de met ontologien beschreven en bewaarde workflow van Mayer omgezet kon worden in een Research Object. Dat kan met gebruikmaking van MyExperiment van Taverne. Er is ook een video van.
Nu is e.e.a. nog in projectstatus, maar dat gaat als product verder gepresenteerd worden.
De tutorial eindigde met een presentatie van Stefan Proell over datacitatie.
Behalve over doi en datacite, ging het ook over andere 'name assigning authorithy numbers' bijvoorbeeld ARK,archival resource key.
Hij gaf ook een demonstratie hoe je zelf bijv een doi of een ark kunt toewijzen.
Al met al een boeiende tutorial, met genoeg aanknopingspunten om verder te lezen.
[de link met verwijzing naar de presentaties zal op de tutorial webpagina van tpdl 2013 komen]

5 sep 2013

Bibliotheek zonder catalogus


Is het mogelijk om de catalogus vaarwel te zeggen in een bibliotheek?

In de bibliotheek staat het vinden centraal: vinden van de juiste informatie die je (de klant) zoekt tot en met het daadwerkelijk leveren van de gevonden informatie al dan niet in digitale vorm.

In een Prezi op Internet lees ik dat Menno Rasch van de Universiteitsbibliotheek Utrecht van het "zoeken" (discovery) als bibliotheek-taak afstand en zich helermaal wil concentreren op "leverantie"(delivery). Hij erkent wel dat dat zonder catalogus nog een uitdaging zal worden.

Die uitdaging wordt gedeeld door UU-collega Pieter Reeve in zijn verslag van de Unconference Infocamp 2013 in de Informatieprofessional 2013/02.


Zelf hebben we besloten om onze catalogus, die we in eerste instantie in Refworks/Endnote hadden opgebouwd om te zetten naar GGC/Worldcat. Een lokaal bibliotheeksysteem hebben we niet meer.

Onze situatie is nu dat al onze boeken (ook e-books) te vinden zijn in Worldcat, maar dat er niet in onze collectie als zodanig gezocht kan worden.

In Worldcat zelf kun je alleen op titel/auteur/jaar etc. zoeken, maar niet binnen een speciale collectie. Ook in Picarta kunnen we niet laten zoeken alleen binnen onze collectie. Ons idee is dat de gebruiker dat ook niet wil.

Je zoekt gewoon een boek en als je een titel gevonden hebt die je wilt hebben ga je kijken waar je dat kunt krijgen. Het zoeken binnen de eigen collectie is in die zin onnodig beperkend.

Een klein beetje onhandig is het wel, want Worldcat toont geen boeknummers. Van Worldcat kun je wel naar de boektitel in Picarta en daar kun je wel de boekcode zien.

De uitlening houden we bij in een Excel-sheet. En zelf kunnen we uiteraard zoeken in de GGC via WinIBW, maar dat is niet geschikt voor gebruikers.

Vraag blijft hoe en of het werkt een bibliotheek zonder catalogus.
Is er inmiddels sprake van een nieuwe paradigma-verschuiving? Na het "van collectie naar connectie" nu dan "van zoeken naar leveren" of beter nog in het Engels "from discovery to delivery".

17 jul 2013

Windows 8 tablet




Ervaringen met een Windows 8 tablet

Na eerdere experimenten met iPad, e-reader en met mijn eigen smartphones (iPhone en Android) is het nu de beurt aan een Windows 8 tablet.
Mijn conclusie uit de test van de bovengenoemde apparaten is dat die apparaten heel handig en bruikbaar zijn als erbij, maar niet ter vervanging van een ‘echte’ pc (een laptop vooral want het gaat ook om het draagbare). Dus neem ik voor vergaderingen, congressen en thuiswerk toch maar weer altijd mijn HP mini laptop mee, inmiddels stokoud, maar redelijk lichtgewicht en als hij maar iedere 2 uur aan de stroom mag voldoet hij goed.

Maar nu dus Asus Vivo Smart tablet met Windows 8.
Ik was Windows 8 nog niet gewend, dus dat betekende eerst een rondgang maken met mijn Microsoft Account (hetzelfde als een Apple account en een Google account), Skydrive geïnstalleerd voor de noodzakelijk cloud-connectie en wat rondneuzen in de Windows store.

Hybride
Het aardige van deze Windows 8 tablet is dat er naast een beginscherm dat bestaat uit ‘tegels’ met apps, een tegel is voor de omschakeling naar de desktop –variant (d.w.z. zoals een ‘normale’ windows pc). En zoals je snelkoppelingen kunt maken op het bureaublad van je oude desktop zo kun je tegels maken van een link in IE naar bijv. Web of Science en naar de Endnote-installatie. Endnote werkt op de normale manier, naar de full text kan worden gezocht en die kan bijgesloten worden en de pdfs kunnen in Endnote worden geopend en – na installatie van Acrobat Pro - ook bewerkt.Dat ziet er allemaal heel vlot uit en is tamelijk snel te realiseren.

Voordeel : Web of Science doorzoeken, citaties downloaden in Endnote, wetenschappelijke teksten lezen en aantekeningen maken, en bladeren door openstaande aplicaties.
Nadeel : weer een eigen account nodig, uitwisseling met PC is niet eenvoudig (geen drive-herkenning bij USB-contact), dus cloud-opslag noodzakelijk.
Ik had het ook fijn gevonden als je bijv. met kabel op netwerk had gekund, nu alleen wifi, en een usb-poort.

Uiterlijk
De Asus Vivo Smart is lekker lichtgewicht, het interne keybord tikt lekker weg. Het beeld is mooi scherp, maar vanwege het vele vegen, swipen en typen op het scherm is het bijgeleverde poetsdoekje geen overbodige luxe.
Hij maakt foto’s en speelt muziek, hoewel naar smaak van mijn ega is het geluid te zacht. Ikzelf vond het geluid wel oke, en je kunt er luidsprekers op aan sluiten.
Als je een dubbel hdmi-kabeltje hebt kun je er ook een beeldscherm op aansluiten, dat is voor thuis ook wel handig.

Windows apps
In de windows app store zijn nog niet erg veel apps te vinden, wel is het een iets rustiger beeld dan bij de Applestore en Google playstore waar schreeuwerigheid kennelijk aantrekkelijk is. Je kunt het aanbod van apps vergroten door in de centrale instellingen je locatie – tijdelijk – om te zetten naar VS. Maar het blijft een beperkte collectie. Men gaat er nu toe over om hele boeken als aparte app aan te bieden ipv in een bibliobeek, dat maakt het niet overzichtelijker. En dan de opslag van de apps, die is in de map ProgramFiles/WindowsApps, maar daar mag ik niet in. Dus met wat gepruts de hele map gekopieerd naar Documents.
Ik heb niet veel apps maar toch al meer dan 1600 mappen met meer den 53k aan bestanden. Neem bijv. De app "Libellen van Nederland' die heeft 22 mappen en 307 bestanden. Nb de submap species heeft 157 foto's. Dat neemt aardig wat in.
Ben ook benieuwd of je de apps die ik nu geïnstalleerd heb, ook op een ander apparaat kan zetten. Nee, dus. Ik heb een andere gebruiker aangemaakt en die krijgt weer een basale charm bar = tegeltjes-bureaublad. De programma’s die via de desktop zijn geïnstalleerd staan wel onder de ‘ all apps’ maar de echte apps niet meer. Ook de map WindowsApps is weg.
Maar als je ook inlogt met je andere Microsoft-account dan kun je alles in een keer (opnieuw) downloaden.

Conclusie
Met een Asus Vivo Smart Windows 8 tablet is heel goed te werken, het gaat minimaal 6 uur mee op een volle batterij, dus wat mi betreft: prima ding!






1 jul 2013

Vakantie in Noorse wateren

Als vakantie dit jaar eens een luxe bootreis met de Celebrity Constellation een '12 Artic nights' cruise. Een fantastische boot met een kleine 15 dekken, 3 liften 2000 gasten en 900 man personeel. Goed verzorgd, alles was tot in de puntjes geregeld, kamer netjes en schoon, eten goed en culinair hoogstaand (porties gelukkig gematigd), zembaden, fitnessruimten en ontspanningsruimten en cafe's aanwezig. Fascinerend ook vond ik de uitleg over het programma 'Save the Waves' waarin ze proberen zo duurzaam mogelijk om te gaan met materialen en verbruikte spullen. Er is een indrukwekkend systeem van afvalwaterverwerking.

Behalve heel veel zee, inclusief daarboven vliegende vogels en een enkele opspringende dolfijn, hebben we wat van de Noorse kust gezien. Zo hebben we een excursie gemaakt op de Lofoten

En een excursie op Spitsbergen

Om daarna verder te varen langs Bereneiland naar de Noordkaap

We hebben de midzomernacht en middernachtzon gevierd aan boord boven de poolcirkel

En zijn uiteindelijk feestelijk gaan sightseeen in Bergen.

10 jun 2013

Web of Science Update


Eigenlijk moet ik zeggen Web of Knowledge, waarvan Web of Science een onderdeel is, is geupdate dit jaar naar versie 5.9 en 5.10.
Er zijn geen grote verbetering of wijzigingen gedaan, maar alle updates zijn het bestuderen waard. Zeker omdat WoS veel gebruikt wordt op ons instituut.
Net als een paar jaar geleden is dit jaar Thomson Reuters Customer Services medewerkster Rachel Mangan naar Nederland afgereisd om de Web of Knowledge Update te presenteren.
Aardige verbeteringen zijn de uitbreidingen met de nabijheids-operator NEAR/x en het zoeken in de WC=xx (Web of Science Categorieen = 250 JCR en WoS onderwerpsaanduidingen). ook het kunnen zoeken op de datum wanneer records verwerkt zijn is een interessante optie (wel opmerkelijk dat in het record nergens te zien is wat de datum van verwerking is). De zoekfuncties op auteur en op organisatie zijn uitgebreid, maar helaas nog steeds niet afdoende (maar dat is wellicht ook niet mogelijk zonder een unieke identifier).
De integratie van RID met ORCID gaat steeds verder en dat lijkt me wel een goed teken, uiteindelijk hopen we dat dat het probleem van de naamsduiding moet oplossen.

Omdat Rachel dit jaar niet naar Wageningen on komen zijn wij naar Amsterdam gegaan. Daar waren we te gast bij de Bibliotheek Betawetenschappen van de Universiteit van Amsterdam.
Van buiten is het gebouw 904 in het Amsterdamse Science Park niet zo geweldig, maar van binnen vond ik het prachtig. Mooi ruim, prachtige trap- en loungepartijen, mooie gekleurde en toch transparante werkkamerblokken in het midden en de balies tegenover de trappen, Er was aardig gesaneerd in de collectie, begerijp ik, maar de studieplekken zijn uitgebreid.

Met dank aan de collega's van de Bibliotheek Betawetenschappen voor de hartelijke ontvangst en het doorsturen van de presentatie van Rachel.
Morgen meteen uitproberen of ik een adminstrator rol kan krijgen voor ons instituut om de Researcherid's voor(deel van) onze onderzoekers bij te werken.

31 mei 2013

Endnote X7 (2)

*
Endnote toolbar in Power Point Er is nu ook een aangepaste werkbalk voor Endnote X7 in Power Point:
Vanuit die werkbalk kun je kiezen voor het invoegen van een citatie en/of het invoegen van een complete referentie (of een set van). Het werkt niet zo als in Word dat hij automatisch een bibliografie toevoegt. Maar je kunt wel in een keer geselecteerde referenties invoegen.
*
Categorieën in je bibliografie In word is het nu mogelijk om te kiezen voor een gecategoriseerde literatuurlijst. Je kunt zelf de categorieën bepalen en sleept dan een voor een de referenties in een categorie. Helaas werkt het niet ' automatisch' zoals bij de Subject Bibliography waarbij je de kopjes uit de velden kunt halen.
Maar het is toch wel een mooie optie.
*
Sync Status en Dialog Het synchroniseren gaat wel sneller dan in versie Endnote X6. Goed aan deze versie is dat je nu de status van de je synchronisatie kunt bekijken (geeft dus aan dat er sinds je laatste sync iets gewijzigd is). Je kunt het automatisch aanzetten, maar gelukkig ook uit.
En bij synchronisatieconflicten kun je met de rechtermuisknop een Sync Error Dialog openen die aangeeft waar de fouten en eventueel dus ook de oplossing ligt.
Maar dat alles-of-niets synchroniseren blijft irritant: hij synchroniseert zelfs de trash!
*
Automatische pdf import
Je kunt in de PDF Handling Preferences aangeven dat je een automatische import wilt van een bepaalde map waarin zich pdf's bevinden. Dat doet hij keurig. De meeste kan hij ook vinden en dus een beschrijving van de metadata toevoegen, een enkele niet. Ze komen terecht in een mapje 'geimporteerde referenties', die je dan zelf naar je Group kunt/moet slepen. Bij handmatige import van een map met pdf's kun je wel aangeven dat die in een aparte groep moeten worden geplaatst.
Hernoemen van pdfs De PDF Handling Preferences geven je de mogelijkheid om te bepalen dat de geimporteerde pdf's van een andere naam moeten worden voorzien. Ik heb gekozen voor Auteur-Jaar. Dat doet hij goed, zie Carvalho-2013:

Hij doet het zelfs zo goed dat er 2 bestanden in het veld File Attachment (lijken te) staan.
Dan wil ik dat met de Windows Verkenner nakijken en ik open het PDF-mapje dat bij deze Endnote Library hoort:

En vraag me dan af, waar ik Carvalho-2013 zou kunnen vinden.

[Het kan : open een pdf, doe een ' save as' en je ziet het nummer waaronder het nu staat. Er staat overigens maar 1 bestand in dat mapje].

De hele update oogt wat stabieler, maar er moet nog wel gewerkt worden aan de pdf's en aan het synchroniseren!